Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SSX1Q16384 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SSX1Q16384 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SSX1Q16384 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SSX1Q16384 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SSX1Q16384 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SSX1Q16384 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SSX1Q16384 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SSX1Q16384 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSX1Q16384 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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