Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USF2Q15853 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USF2Q15853 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USF2Q15853 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USF2Q15853 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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