Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRK1Q15835 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRK1Q15835 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRK1Q15835 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRK1Q15835 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRK1Q15835 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRK1Q15835 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRK1Q15835 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRK1Q15835 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRK1Q15835 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GRK1Q15835 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GRK1Q15835 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GRK1Q15835 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRK1Q15835 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms