Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPAQ15257 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms