Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECTIN1Q15223 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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