Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GBX1Q14549 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBX1Q14549 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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