Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM25Q14258 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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