Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM53BQ14153 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms