Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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