Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA1CQ13936 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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