Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H2Q13888 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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