Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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