Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RESTQ13127 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RESTQ13127 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RESTQ13127 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RESTQ13127 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RESTQ13127 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RESTQ13127 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RESTQ13127 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RESTQ13127 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RESTQ13127 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RESTQ13127 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RESTQ13127 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RESTQ13127 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RESTQ13127 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RESTQ13127 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RESTQ13127 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RESTQ13127 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RESTQ13127 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RESTQ13127 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RESTQ13127 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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