Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
POU3F1Q03052 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POU3F1Q03052 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POU3F1Q03052 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
POU3F1Q03052 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POU3F1Q03052 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms