Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUCB1Q02818 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB1Q02818 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms