Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms