Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF9Q00978 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms