Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLCB2Q00722 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms