Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms