Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELF3P78545 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ELF3P78545 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELF3P78545 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELF3P78545 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms