Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX5P78411 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX5P78411 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX5P78411 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX5P78411 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX5P78411 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX5P78411 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX5P78411 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX5P78411 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX5P78411 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX5P78411 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX5P78411 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX5P78411 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX5P78411 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX5P78411 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX5P78411 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX5P78411 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX5P78411 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX5P78411 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX5P78411 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX5P78411 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX5P78411 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX5P78411 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX5P78411 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX5P78411 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX5P78411 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX5P78411 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX5P78411 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX5P78411 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX5P78411 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX5P78411 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms