Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HBBP68871 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HBBP68871 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HBBP68871 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms