Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVS71-1P61550 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms