Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV3P56539 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV3P56539 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV3P56539 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV3P56539 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV3P56539 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV3P56539 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV3P56539 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV3P56539 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV3P56539 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV3P56539 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV3P56539 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV3P56539 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAV3P56539 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAV3P56539 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAV3P56539 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAV3P56539 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV3P56539 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms