Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.651e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.639e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.639e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 CARD10-204ENST00000433485 578 ntTSL 431.44■■■□□ 2.629e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 RALGPS1-202ENST00000319107 770 ntTSL 331.07■■■□□ 2.569e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 RALGPS1-205ENST00000373439 1527 ntTSL 530.96■■■□□ 2.559e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 TCF12-215ENST00000560190 1183 ntTSL 1 (best)30.67■■■□□ 2.59e-7■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.459e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 RNF126-206ENST00000592626 652 ntTSL 230.27■■■□□ 2.449e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.293e-7■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.243e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ERMP1-205ENST00000487088 2799 ntTSL 528.67■■■□□ 2.189e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ZNF577-208ENST00000638721 556 ntTSL 428.5■■■□□ 2.158e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)28.48■■■□□ 2.159e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)28.48■■■□□ 2.159e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.159e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.129e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 GARS-206ENST00000478124 1877 ntTSL 528.06■■■□□ 2.089e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 CARD10-205ENST00000437756 2140 ntTSL 1 (best)28.02■■■□□ 2.089e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 STK25-232ENST00000495372 561 ntTSL 227.77■■■□□ 2.049e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)27.44■■□□□ 1.989e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 TNPO1-211ENST00000518279 563 ntTSL 427.37■■□□□ 1.979e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ZNF577-210ENST00000638827 1856 ntTSL 527.2■■□□□ 1.948e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.921e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.914e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.859e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.813e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.811e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.779e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ERCC2-202ENST00000391942 1488 ntTSL 225.96■■□□□ 1.759e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 EEF1D-222ENST00000528519 553 ntTSL 325.91■■□□□ 1.749e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 SLC15A4-204ENST00000376744 2402 ntTSL 225.61■■□□□ 1.691e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 TNPO1-212ENST00000520850 863 ntTSL 225.44■■□□□ 1.669e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 NEK7-205ENST00000442588 519 ntTSL 525.26■■□□□ 1.633e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 KANTR-204ENST00000604849 1196 ntTSL 525.23■■□□□ 1.639e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 IGF2BP1-205ENST00000510023 754 ntTSL 325.07■■□□□ 1.62e-10■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 CFAP20-207ENST00000567660 731 ntTSL 224.92■■□□□ 1.589e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.579e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.573e-7■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ERCC2-211ENST00000588652 2405 ntTSL 224.75■■□□□ 1.559e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 TNPO1-210ENST00000515483 549 ntTSL 424.49■■□□□ 1.519e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ZNF577-205ENST00000638423 512 ntTSL 424.02■■□□□ 1.448e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ZNF577-215ENST00000639703 641 ntTSL 324.02■■□□□ 1.448e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.429e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ZNF577-216ENST00000640429 453 ntTSL 323.92■■□□□ 1.428e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 RPRD1A-211ENST00000592674 566 ntTSL 423.75■■□□□ 1.399e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 RPRD1A-208ENST00000589050 1022 ntTSL 1 (best)23.75■■□□□ 1.399e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.399e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ZNF577-207ENST00000638684 473 ntTSL 523.67■■□□□ 1.388e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ZNF577-218ENST00000640955 1865 ntTSL 223.22■■□□□ 1.318e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.319e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.39e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 STK25-216ENST00000440109 935 ntTSL 323.09■■□□□ 1.299e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 DGKD-212ENST00000489613 890 ntTSL 523.08■■□□□ 1.299e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.279e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ERMP1-206ENST00000489219 3293 ntTSL 1 (best)22.84■■□□□ 1.259e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.231e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.239e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 GCA-205ENST00000446271 691 ntTSL 522.69■■□□□ 1.229e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.125e-7■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 GCA-210ENST00000487445 1808 ntTSL 521.79■■□□□ 1.089e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ERMP1-203ENST00000462592 3554 ntTSL 221.6■■□□□ 1.054e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 CFAP20-203ENST00000562622 1605 ntTSL 521.57■■□□□ 1.049e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 CFAP20-205ENST00000565880 572 ntTSL 321.56■■□□□ 1.049e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.049e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 SRSF5-210ENST00000555412 572 ntTSL 221.19■□□□□ 0.987e-7■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.983e-7■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.963e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.969e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.949e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 PHKB-203ENST00000563376 697 ntTSL 320.81■□□□□ 0.921e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 EZH2-209ENST00000492143 3641 ntTSL 220.63■□□□□ 0.893e-7■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 EEF1D-214ENST00000526135 535 ntTSL 220.45■□□□□ 0.869e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 SRSF5-214ENST00000556436 611 ntTSL 220.37■□□□□ 0.855e-7■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.849e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.819e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ACSS3-206ENST00000549175 534 ntTSL 520.03■□□□□ 0.89e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ZNF430-202ENST00000594110 536 ntTSL 419.99■□□□□ 0.799e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.755e-7■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.759e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.748e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.739e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 GCA-208ENST00000479199 597 ntTSL 219.52■□□□□ 0.729e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 CACNB4-226ENST00000636496 430 ntTSL 519.35■□□□□ 0.699e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.689e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ZNF577-209ENST00000638814 444 ntTSL 219.14■□□□□ 0.658e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.659e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.659e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.629e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.69e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ZDHHC7-206ENST00000569017 483 ntTSL 418.72■□□□□ 0.598e-7■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 SRSF5-215ENST00000556587 1863 ntTSL 1 (best)18.7■□□□□ 0.585e-7■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ZNF577-206ENST00000638538 573 ntTSL 418.68■□□□□ 0.588e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.549e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 SPTLC1-201ENST00000262554 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ZC3H18-204ENST00000564161 4654 ntTSL 218.14■□□□□ 0.499e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.489e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 TCF12-212ENST00000559609 2252 ntTSL 217.79■□□□□ 0.449e-7■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 ZNF577-204ENST00000638348 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.79■□□□□ 0.448e-6■■■■□ 22.2
HNRNPMP52272 CFAP20-206ENST00000567092 710 ntTSL 217.77■□□□□ 0.449e-6■■■■□ 22.2
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 231.7 ms