Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LUMP51884 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LUMP51884 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LUMP51884 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LUMP51884 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LUMP51884 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LUMP51884 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LUMP51884 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LUMP51884 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms