Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAMP50895 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAMP50895 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BCAMP50895 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAMP50895 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAMP50895 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAMP50895 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms