Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF6P49848 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF6P49848 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF6P49848 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF6P49848 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF6P49848 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF6P49848 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF6P49848 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms