Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP8P40818 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP8P40818 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP8P40818 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP8P40818 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP8P40818 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP8P40818 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP8P40818 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP8P40818 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP8P40818 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP8P40818 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP8P40818 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP8P40818 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP8P40818 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP8P40818 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP8P40818 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP8P40818 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms