Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms