Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms