Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms