Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GCSHP23434 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GCSHP23434 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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