Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms