Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GM2AP17900 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GM2AP17900 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GM2AP17900 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GM2AP17900 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GM2AP17900 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GM2AP17900 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GM2AP17900 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GM2AP17900 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GM2AP17900 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GM2AP17900 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GM2AP17900 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GM2AP17900 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GM2AP17900 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GM2AP17900 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GM2AP17900 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GM2AP17900 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GM2AP17900 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GM2AP17900 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GM2AP17900 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GM2AP17900 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GM2AP17900 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GM2AP17900 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GM2AP17900 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GM2AP17900 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GM2AP17900 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GM2AP17900 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GM2AP17900 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GM2AP17900 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GM2AP17900 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GM2AP17900 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GM2AP17900 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GM2AP17900 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GM2AP17900 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GM2AP17900 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms