Protein–RNA interactions for Protein: P0DN87

CGB7, Choriogonadotropin subunit beta 7, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB7P0DN87 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGB7P0DN87 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms