Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CT47B1P0C2W7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms