Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERPIND1P05546 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms