Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN9O95484 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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CLDN9O95484 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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CLDN9O95484 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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CLDN9O95484 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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CLDN9O95484 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CLDN9O95484 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CLDN9O95484 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN9O95484 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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