Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG12O94817 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG12O94817 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG12O94817 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG12O94817 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG12O94817 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG12O94817 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG12O94817 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG12O94817 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms