Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 BMPR1A-203ENST00000635816 3238 ntTSL 53.83□□□□□ -1.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CIB2-206ENST00000559054 443 ntTSL 23.78□□□□□ -1.83e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KIF21A-214ENST00000636569 6157 ntTSL 53.77□□□□□ -1.813e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 33.76□□□□□ -1.813e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.813e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.813e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GYPA-205ENST00000508337 622 ntTSL 1 (best)3.73□□□□□ -1.813e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.812e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EXTL2-203ENST00000416479 730 ntTSL 23.71□□□□□ -1.813e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.823e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.823e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 OFD1-207ENST00000474705 496 ntTSL 23.69□□□□□ -1.823e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.823e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 33.67□□□□□ -1.823e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.833e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.833e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DIABLO-211ENST00000485724 560 ntTSL 23.64□□□□□ -1.832e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NBN-211ENST00000613033 786 ntTSL 33.62□□□□□ -1.833e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.833e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MYO1D-203ENST00000577252 558 ntTSL 53.54□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 USP25-205ENST00000449491 687 ntTSL 53.53□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EBAG9-206ENST00000530629 706 ntTSL 33.52□□□□□ -1.852e-8■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF814-204ENST00000595048 389 ntTSL 53.5□□□□□ -1.853e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.49□□□□□ -1.853e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATP6V1A-202ENST00000461496 542 ntTSL 53.49□□□□□ -1.853e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SLC39A10-209ENST00000465851 2009 ntTSL 53.49□□□□□ -1.853e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RBBP8-216ENST00000585177 606 ntTSL 33.48□□□□□ -1.853e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.852e-8■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FCF1-204ENST00000553673 547 ntTSL 43.47□□□□□ -1.853e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PIK3R4-203ENST00000507330 563 ntTSL 43.46□□□□□ -1.853e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.863e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.863e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF131-211ENST00000508795 465 ntTSL 53.44□□□□□ -1.862e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CCDC146-203ENST00000415750 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 43.42□□□□□ -1.863e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CWF19L1-208ENST00000496796 727 ntTSL 33.4□□□□□ -1.873e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMEM144-211ENST00000511532 2861 ntTSL 1 (best)3.39□□□□□ -1.873e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.873e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTDC1-209ENST00000417450 601 ntTSL 43.29□□□□□ -1.883e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RPAP3-205ENST00000548211 555 ntTSL 23.29□□□□□ -1.883e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 UBR1-211ENST00000569971 721 ntTSL 43.28□□□□□ -1.883e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB20-214ENST00000480832 574 ntTSL 33.26□□□□□ -1.893e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.893e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 VPS13B-209ENST00000521559 466 ntTSL 33.24□□□□□ -1.893e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB20-220ENST00000492665 475 ntTSL 33.19□□□□□ -1.93e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB38-205ENST00000506623 596 ntTSL 43.19□□□□□ -1.93e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CEP70-206ENST00000468900 1016 ntTSL 53.17□□□□□ -1.93e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CCDC150-219ENST00000498512 555 ntTSL 53.15□□□□□ -1.913e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EIF4G3-209ENST00000463775 711 ntTSL 33.15□□□□□ -1.913e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DNAJC27-206ENST00000494239 547 ntTSL 43.13□□□□□ -1.913e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.912e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MYO18A-222ENST00000590565 261 ntTSL 33.1□□□□□ -1.913e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DENND1B-203ENST00000294738 508 ntTSL 53.1□□□□□ -1.912e-8■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DNAJC27-205ENST00000492985 485 ntTSL 23.09□□□□□ -1.913e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.922e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FCF1-208ENST00000556814 571 ntTSL 43.08□□□□□ -1.923e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BTF3-205ENST00000509708 515 ntTSL 53.07□□□□□ -1.923e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PLEKHO1-208ENST00000502767 484 ntTSL 23.02□□□□□ -1.933e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATXN1-203ENST00000467008 3362 ntTSL 1 (best)3.01□□□□□ -1.933e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MAP4K5-202ENST00000554066 595 ntTSL 32.97□□□□□ -1.933e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SDCCAG8-208ENST00000491888 286 ntTSL 32.97□□□□□ -1.933e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RIOK1-201ENST00000264874 1988 ntTSL 52.97□□□□□ -1.933e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.943e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TBC1D9B-203ENST00000517782 283 ntTSL 52.95□□□□□ -1.943e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EFCAB11-210ENST00000556078 449 ntTSL 32.95□□□□□ -1.943e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MYO1D-207ENST00000580538 552 ntTSL 42.95□□□□□ -1.943e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.953e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.963e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PPP2R5E-205ENST00000556150 744 ntTSL 32.81□□□□□ -1.963e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EVI5-207ENST00000492613 495 ntTSL 32.81□□□□□ -1.963e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CAMSAP2-205ENST00000475326 451 ntTSL 52.8□□□□□ -1.963e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PPFIA1-212ENST00000528853 745 ntTSL 32.77□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATAD2B-203ENST00000381024 5579 ntTSL 1 (best)2.75□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 UBXN4-208ENST00000490163 3394 ntTSL 22.74□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LCMT1-AS1-203ENST00000566507 389 ntTSL 32.72□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CCDC150-217ENST00000495513 710 ntTSL 32.72□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CD55-207ENST00000465534 1480 ntTSL 1 (best)2.72□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB38-207ENST00000507722 593 ntTSL 22.7□□□□□ -1.983e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.983e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BMPR1A-202ENST00000480152 421 ntTSL 32.66□□□□□ -1.983e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SMAD4-207ENST00000589076 576 ntTSL 52.61□□□□□ -1.993e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PEAK1-207ENST00000565820 558 ntTSL 42.6□□□□□ -1.993e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CWF19L1-203ENST00000466955 659 ntTSL 32.54□□□□□ -23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CEP83-214ENST00000552632 705 ntTSL 32.52□□□□□ -2.013e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 REV3L-213ENST00000494858 281 ntTSL 32.51□□□□□ -2.013e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.023e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 QKI-215ENST00000544823 597 ntTSL 22.45□□□□□ -2.022e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.023e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NR2C1-216ENST00000552484 465 ntTSL 42.45□□□□□ -2.023e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATR-202ENST00000504521 718 ntTSL 22.37□□□□□ -2.033e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.032e-8■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 UBE2D3-218ENST00000505009 440 ntTSL 22.34□□□□□ -2.043e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FCF1-205ENST00000554064 605 ntTSL 42.33□□□□□ -2.043e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB38-216ENST00000513249 572 ntTSL 42.32□□□□□ -2.043e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DPY19L1-204ENST00000462134 574 ntTSL 42.29□□□□□ -2.043e-6■■■■■ 137.9
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