Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms