Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms