Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms