Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F3O00716 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F3O00716 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F3O00716 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms