Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms