Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms