Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF3BA8MYP8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms