Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L5A8MUK1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L5A8MUK1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms