Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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